近年来，巴彦淖尔市充分发挥风光资源、口岸边贸、当地矿产资源等优势，逐步形成了以农畜产品加工、矿山冶金、电力工业、化学工业等支柱产业为主体的工业体系。目前，已成为全球最大有机牛奶生产基地（有机认证牛奶占全球产能近50%）、全球最大6APA抗生素原料药生产基地（6APA产能占全球60%）；全国最大四季均衡出栏肉羊生产加工基地、全国最大无毛绒集散加工基地（无毛绒集散量占全国45%）、全国最大葵花生产加工交易基地（出口量占全国40%）、全国第二大番茄种植加工基地（出口量占全国20%）。

  巴彦淖尔市确立了“两个基地、四个产业集群及12条产业链”的发展定位，进行重点招商引资、承接产业转移。

  两个基地：绿色农畜产品精深加工基地、清洁能源和战略资源综合开发利用基地；

  四个集群：装备制造、新材料、生物医药、新型冶金化工产业集群；

  12条产业链：奶业、肉羊、肉牛、羊绒、向日葵、小麦、现代煤化工、铜锌深加工、生物医药、风电装备、光伏装备、农机装备。

  同时，制定出台了《巴彦淖尔市招商引资促进高质量发展优惠政策》、《关于加快羊毛羊绒羊皮产业发展实施方案（2023年-2025年）》等相关优惠政策。

  目前，巴彦淖尔市有工业园区（开发区）4个，其中国家级园区1个，自治区级园区3个，各园区围绕全市12条重点产业链，按照园区功能定位，成为承接各类产业项目的重点区域。

  其中，巴彦淖尔经济技术开发区形成了农畜产品精深加工基地、绒纺产业园、医药产业园、新能源新材料和装备制造产业园、新能源制造产业链“四园一业”的产业形态。

  河套农畜产业开发区3个区块主攻农畜产品精深加工，杭后工业园以农畜产品精深加工业和农资机械装备制造业为主，重点围绕生物合成、酒业集群、乳业全产业链发展。五原工业园以绿色农畜禽产品加工为主导，以农机装备制造为辅助、并以电子商务和现代物流为依托。磴口工业园是以发展农畜产品加工、化工、电力、清洁能源为主的综合性循环经济工业园区，同时重点围绕新能源产业链条打造“光伏+生态治理”产业模式。

  进口资源加工开发区2个区块产业发展以化学工业、冶金为主攻方向，其中乌拉特前旗产业园以新型煤化工、冶金钢铁为主导产业，同时发展新能源、新材料和新型环保等产业。甘其毛都口岸加工园依托口岸优势，重点发展过境资源加工产业，以煤化工、装备制造为主导，同时发展非金属矿产加工。

  乌拉特后旗工业园区以有色金属冶炼、化工循环经济产业为主导，配套发展关联循环产业和现代服务业，努力打造成为自治区重要的循环经济示范基地和西部有色金属产业基地。